Recreatie- en beroepsvaart moeten voortaan stuurboordwal houden in het Krabbersgat. Rijkswaterstaat heeft aan de noord- en aan de zuidzijde van het vaarwater borden geplaatst die de nieuwe situatie duidelijk maken. Ook aan de Markermeerkant van het naviduct staan dergelijke borden. Volgens de nieuwe regel mogen zeiljachten niet meer laveren in het Krabbersgat. Zeilen is nog wel toegestaan, indien de koers bezeild is en stuurboordwal gehouden kan worden. De Waterpolitie gaat deze zomer streng controleren op naleving van de regel.
Met de komst van het naviduct is een kruising van meerdere vaarwegen ontstaan. Schippers kunnen vanaf de noordzijde komend de Buitenhaven in, doorvaren naar de Gependam of Buyshaven of ze kunnen bakboord uit naar het naviduct. Ze mogen dan niet bij het invaren van het Krabbersgat meteen bakboordwal houden om zo de drukte bij de havens van Enkhuizen te ontlopen. Pas ter hoogte van de Buitenhaven kunnen ze oversteken naar de toegangsgeul van het naviduct.
Ook de pont van het Zuiderzeemuseum moet voortaan stuurboordwal houden. Deze voer vaak aan de bakboordzijde van het vaarwater van het Centraal Station naar de ingang van de Compagnieshaven, om zo het Krabbersgat niet te hoeven oversteken. De museumpont moet nu vanaf het Centraal Station naar de stuurboordoever van het Krabbersgat varen en bij de ingang van de Compagnieshaven weer oversteken. Volgens het BPR moet de recreatievaart wijken voor de museumpont. Schepen die ingericht zijn om meer dan acht personen te vervoeren zijn in de zin van het BPR een groot schip. Kleine schepen wijken hiervoor uit. Volgens voorlichter Ed Kraszewski van de KLPD moet de pont zich daarentegen wel aan de regels van goed zeemanschap houden.
